Samotný jev bilokace není dosavadně z vědeckého hlediska dostatečně probádán, tudíž prozatím neexistuje jeho racionální vysvětlení.
Svědky těchto podivných událostí bývají ve většině případů příbuzní či kamarádi dotyčných, mohlo by se tedy jednat např. o formu ovlivňování na dálku větší skupiny lidí.
Úkaz by tak mohl spadat do rovněž prozatímně nepříliš prozkoumané oblasti psychotroniky.
Synchronizovaná vlnová funkce
Fyzik Claude Swanson (1862-1939) se domníval, že je možné bilokaci vysvětlit tak, že se jedná o synchronizovanou vlnovou funkci.
Na lidské tělo se podle tohoto hlediska nahlíží jako na kvantový systém se sadou kvantových stavů, které všechny najednou synchronně vibrují.
Přitom může dojít k tomu, že zásoba energie, kterou lidské tělo generuje, může objevit v reálném světě. Na základě tvrzení by se dalo předpokládat, že k bilokaci napomáhají stavy typu transu (extáze) či hluboké meditace bez ohledu na náboženskou víru.
Neplést si pojmy
Fenomén „být na dvou místech zároveň“ lze rozdělit na dva základní druhy. Jedním z nich je tzv. bilokace, kdy je jedinec pozorován na dvou místech současně. Obě poloviny jsou pohyblivé a aktivní, jedna však nemusí vědět o tom, co dělá ta druhá.
Oproti tomu při tzv. astrálním cestování dochází ke stavu, kdy vědomí opouští své nehybné tělo a tato substance je pak schopna pozorovat dění napříč prostorem a časem.
Při bilokaci má dvojník možnost působit na své okolí, poněvadž se nalézá v hmotném stavu. Astrální cestovatel však není okem viditelný a nemůže mít vliv na hmotné předměty. Jeho role je omezena pouze na roli pozorovatele.